En 1247 se llamaba «Fuent Ruvia», por la fuente o manantial de aguas rojizas que aporta la arcilla característica de esa zona, mientras que en los documentos del s.  XVI se duda entre Honrrubia y Fuenrrubia.

A mediados del s. XIX se cita ya como «Honrubia» y «Fuenrubia»; siendo en el s. XX cuando se añade el sufijo «de la Cuesta».

Durante la invasión francesa de principios del s. XIX hubo varias batallas de guerrillas contra el invasor francés, destacando entre los más famosos guerrilleros a Juan Martín Díez (1775-1825) apodado El Empecinado; Juan Martín Díez aunque natural de Castrillo de Duero realizó varias actuaciones en esta y otras localidades circundantes. Es legendario «El Salto del Caballo» al interceptar, en Honrubia de la Cuesta, un correo francés formado por cuatro soldados.

Formó parte de la antigua Comunidad de Villa y Tierra de Montejo, que incluía municipios de las actuales provincias de Burgos y Segovia.

Haciendo honor a su apellido, las pendientes marcan la orografía del término municipal. Geográficamente está entre las montañas del Sistema Central y el valle del Duero en la zona de producción vinícola de la Denominación de Origen Ribera de Duero, abundan por ello en el término los cultivos de vid y las bodegas excavadas en la rojiza y arcillosa tierra que también imprime un carácter especial a esta zona, en la que la producción vinícola comenzaba casi a desaparecer hasta que volvió la pujanza económica de la Ribera.

El casco urbano es un conjunto irregular de calles en las que las casas, de dos plantas la mayoría, se apiñan en torno a la plaza, presidida por un Ayuntamiento. En las construcciones se alternan la piedra y el adobe, pero en casi todas resalta el color rojizo para ambos materiales.

Los prados próximos han servido durante años para alimentar ganado, especialmente ovino. La iglesia parroquial está dedicada a San Cristóbal. Se levanta sobre gruesas piedras y está formada por una amplia nave, con crucero y una alta torre. A la afueras, cerca de la autovía se encuentra la ermita de Nuestra Señora del Lirio. Es de planta cuadrada y su aspecto actual data del siglo XVIII. Su origen se debe a la leyenda que relata que en el lugar apareció la Virgen con un lirio en la mano.

--

Situada a casi 100 kilómetros de la capital segoviana, en el límite con la provincia de Burgos, por la  Autovía del Norte (A-1) que pasa a dos kilómetros al oeste de su casco urbano, se llega a Pardilla (Burgos) a unos 5,8 km.

Al este, por una sinuosa carretera para salvar el río Barranco de los Callejones, se llega a Villaverde de Montejo tras 8,8 km aunque en línea recta esté a la mitad de distancia. Villalvilla de Montejo, al sureste a 9,6 km. Al sur por la A-1, Carabias a 8,9 km. Aldehorno está a 13,9 km pasando por Pardilla al norte y por Fuentenebro (9,3 km) ambas poblaciones de Burgos.

Fiestas y Tradiciones

Rogativa
Del 15 al 20 de mayo Para la fiesta la imagen se sube a la ermita. Allí se procesiona para pedir por una buena cosecha y después el ayuntamiento invita a un tentempié; la gente suele compartir una comida popular en los alrededores que generalmente organiza la cofradía de Nuestra Señora la Virgen del Lirio y por la tarde se reza el rosario. Normalmente acude casi todo el pueblo y la gente que viene de fuera con la idea de pasar un día junto con los cofrades y no cofrades.

Fiestas de la Virgen del Lirio
Primer fin de semana de julio y primer fin de semana de septiembre. Se celebra en la ermita la correspondiente misa en Honor a la patrona del pueblo la Virgen del Lirio, y después de la misa se lleva a cabo la procesión por todo el entorno de la ermita, y una vez terminada ésta, antes de meter a la Virgen en la ermita, se subastan las cintas y los palos.

El dinero obtenido, es íntegramente para sufragar los gastos y mantenimiento del templo. Incluyen baile, concursos y actividades infantiles. Se está recuperando la tradición de ir a comer a la antigua tejera el lunes de la fiesta. La tradición dice que La Virgen del Lirio está hermanada con la de Las Vegas de Aranda y la de Hontanares, por lo que si se orientan de tal forma que se miren, favorece la llegada de lluvia.